22世纪末，被人类称作“加米拉斯”的不明外星生物盘踞火星，并持续向地球发射带有陈源锐利的目光看见少年的怀里果然抱着一台微型的手提光脑，像宝贝似的紧紧抱着，他这个样子和天台上其他人相比，就显得格格不入，因为其他人当作宝贝不是吃的就是喝的，没有一个人像他一样把一台既不能吃也不能喝的光脑抱在怀里。强烈放射姓物质的游星炸弹，致使地球人死伤无数，濒临灭绝，被迫转到地下求生。在这紧要关头，人类组成宇宙舰队远征火星，结果几乎全军覆没，侥幸逃回的大和号成为人类最后的希望。与此同时，一个神秘装置穿越万里银河坠落地球，经检测发现该装置竟然能消除放射姓物质。为了从装置的主人——麦哲伦星云伊斯坎达尔星的高智慧生物那里寻求帮助，人类决定孤注一掷，派遣大和号进行这次远征。火星之战中失去哥哥的原宇宙舰队成员古代进（木村拓哉饰）应召归队，和一众好友成为了见证伟大历史时刻的一员。而得知人类动向的加米拉斯也发起了一波波的致命攻击…… 本片根据松本零士的同名原著改编。
